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 Arraystar公司miRStar™人肿瘤相关microRNA PCR芯片

     miRNA是一类具有调控功能的非编码RNA分子,其长度约22个核苷酸左右。miRNA可以通过碱基互补的方式和靶标mRNA结合,而后降解mRNA沉默基因的表达。一个miRNA 可以调控近百个不同的mRNA分子,另一方面,一个mRNA也能够结合多个不同的miRNA。由此形成miRNA-靶基因网络调控关系。人类细胞中存在上千个microRNA,调控着超过60%的基因。通过调控靶标mRNA, miRNA参与到许多重要的生物学过程,并且与疾病的发生发展密切相关。在癌症研究领域中,miRNA已经成为一个非常重要的部分。
     传统的miRNA检测平台只检测miRNA的表达状况,不能平行的检测miRNA和靶基因,从而无法全面的了解miRNA-靶基因调控网络。
     Arraystar公司开创性的设计了miRStar™miRNA PCR芯片系统,可以同时检测癌症相关的miRNA和它们的靶基因。它不仅能够快速检测样品中癌症相关的microRNA的表达变化,还可以评估这些miRNA对靶标mRNA的调控活性,从而帮助研究者筛选到疾病中最为核心的功能miRNA分子。

康成生物是Arraystar公司中国地区唯一代理商,独家为您提供Arraystar公司miRStarTM microRNA PCR芯片全程一站式技术服务,您只需要提供保存完好的组织或细胞标本,康成的芯片技术服务人员就可为您完成全部实验操作,并提供完整的实验报告。


miRStar™癌症特异性 microRNA PCR芯片产品列表

芯片名称
芯片
 规格
描述
miRStar™ Human Cancer Focus miRNA & Target mRNA PCR Array Service NEW!
Human Cancer Focus miRNA & Target mRNA PCR Array
384-well plate
184个癌症相关的miRNA + 178个靶基因
miRStar™ Human Cancer Focus miRNA PCR Array Service NEW!
Human Cancer Focus miRNA PCR Array
384-well plate
184个癌症相关的miRNA

1. miRStar™癌症特异性 miRNA & 靶基因 PCR芯片(同时检测癌症相关的miRNA和靶基因)

芯片特点
 最优的覆盖—对癌症相关miRNA最全面、最及时的收集
• 同时检测miRNA和靶基因—在同一块PCR板上同时检测184个与癌症密切相关的miRNA和178个靶基因
• 高灵敏度—采用优化的实验流程,直接用总RNA进行反应,无需对miRNA进行富集,起始RNA量可低至50ng。
• 均一性好—所有的PCR引物Tm值均经过优化,在同一qPCR条件下板内不同基因间具有良好的均一性
 验证过的性能—PCR芯片上的所有miRNA引物都在血清血浆样品中验证过,实验结果具有高度的重复性(R2 = 0.99)。
• 快速简易—即用型384孔板规格,只需将miRNA的cDNA与qPCR Master Mix试剂混合后加入PCR板中,即可进行qPCR 反应。整个实验流程在4小时内完成。

聚焦于癌症相关的miRNA和靶基因
   Arraystar实时的关注各种权威的文献和数据库,并通过严谨的筛选流程从中收集癌症关系最密切的miRNA。Arraystar’s miRStar™ 癌症特异性PCR芯片是市场上对癌症相关的miRNA覆盖最全面、更新最及时、最合理的PCR芯片产品(表1)。

芯片类型
Arraystar miRStar™ Human Cancer Focus miRNA & Target mRNA PCR Array
Arraystar miRStar™ Human Cancer Focus miRNA PCR Array
Company I
Cancer PathwayFinder miRNA PCR Array
Company II
Cancer Focus miRNA PCR Panels
miRNA数目
184
184
84
84
miRNA靶基因数目
178
n.a.
n.a.
n.a.
miRBase数据库版本
V20
V20
V16
V19

表1. Arraystar肿瘤特异性miRNA PCR芯片与竞争公司产品的比较
 
     miRStar™癌症特异性miRNA & 靶基因 PCR芯片包含癌症相关的184个miRNA以及这些miRNA的178个靶标mRNA分子。184个miRNA是从最新的文献中精心筛选,涵盖了与胃癌,肝癌,肺癌,乳腺癌,卵巢癌,结直肠癌,胰腺癌,前列腺癌等常见肿瘤相关的miRNA(见表2)。178个靶标mRNA有大量的文献支持,其表达水平的变化与肿瘤中microRNA的功能活性改变有关。为了保证数据质量,miRStar™芯片 包含了一系列内参(见表2),用于监控可能出现的DNA污染,评估逆转录、qPCR的效率,或是用于后续的数据标准化。

    表2. miRStar™癌症特异性microRNA & 靶基因 PCR芯片包含的miRNA(黄色背景),mRNA(紫色背景)和内参(红色方框). 癌症相关的miRNA数目:胃癌;97; 肝癌:113; 肺癌:156;  乳腺癌:157;  卵巢癌:123;  结直肠癌:130;  胰腺癌:139;  前列腺癌:140

    不同类型癌症样品具有不同的基因表达模式,因此,即使是相同的miRNA,它们在不同类型样品中的调控的靶基因往往是不同的。miRStar™ 癌症特异性miRNA & 靶基因PCR芯片不仅可以检测miRNA的表达,还可以提供相应靶基因的表达数据。这可以帮助客户迅速找到在癌症样品中表达失调的miRNA/靶基因对,从而迅速了解样品特异性的miRNA/mRNA相互作用网络,并解析miRNA在特定肿瘤中的功能和调控机制。

优秀的产品性能
     miRStar™ PCR芯片系统采用优化的实验流程(见下图),通过miRStar™第一链cDNA合成试剂盒直接将总RNA中的miRNA和mRNA转化为cDNA,无需富集小RNA,可用低至50ng的RNA作为Input。所有的miRNA引物都在血清和血浆样品中验证过,证实了它们作为分子标志物的潜能。

上图. miRStar™癌症特异性miRNA & 靶基因PCR芯片工作流程

2. miRStar™癌症特异性 miRNA PCR芯片对癌症相关miRNA最全面的覆盖
     在芯片设计上,Arraystar选择将两套184个癌症相关的microRNA探针点制在一块384孔板上,使研究者可以同时在一块PCR板上检测癌症和正常的实验样品,有助于减少实验误差,获得更准确检测结果。因此该款芯片是预后或诊断生物标志物检测的最佳选择。

芯片特点
• 最优的覆盖—对癌症相关的miRNA最全面,最及时地收集
• 同时检测两个样品—在同一块PCR板上同时检测2个样品,如癌症样品 vs 正常样品或是两个生物学重复,样品间的技术误差几乎可以忽略不计
• 高灵敏度—采用优化的实验流程,直接用总RNA进行反应,无需对miRNA进行富集,起始RNA量可低至50ng。
• 快速简易—即用型384孔板规格,只需将miRNA的cDNA与qPCR Master Mix试剂混合后加入PCR板中,即可进行qPCR反应。整个实验流程在4小时内完成。
• 均一性好—所有的PCR引物Tm值均经过优化,在同一qPCR条件下板内不同基因间具有良好的均一性
• 验证过的性能—PCR芯片上的所有miRNA引物都在血清血浆样品中验证过,实验结果具有高度的重复性(R2 = 0.99)。

最优的覆盖
     Arraystar实时的关注各种权威的文献和数据库,并通过严谨的筛选流程从中收集癌症关系最密切的miRNA。miRStar™ 癌症特异性miRNA PCR芯片是市场上对癌症相关的miRNA覆盖最全面、更新最及时、最合理的PCR芯片产品(下表)。
癌症类型
miRNA数目
乳腺癌
157
胃癌
97
肺癌
156
肝癌
113
卵巢癌
123
结直肠癌
130
胰腺癌
139
前列腺癌
140
         上表. miRStar™癌症特异性 miRNA PCR芯片覆盖的与特定癌症相关的miRNA数目

验证过的性能
    
miRStar™ 癌症特异性miRNA PCR芯片上每条miRNA引物都经过了精心的设计,并且在血清血浆样品中进行了验证。预验证的结果既确保了芯片的可靠性,又证实了这些癌症相关的miRNA在血清血浆中的稳定性,进一步预示了其作为癌症分子标志物的可能性。

上图. 在血清样品中,使用miRStar™ 预验证的 hsa-miR-142-3p特异性PCR引物的实时定量PCR扩增曲线(A)和熔解曲线(B)。溶解曲线呈现锐利的单峰,表明了反应具有很高的特异性。

同时检测两个样品
     miRStar™癌症特异性 miRNA PCR芯片可以在同一块PCR板上同时检测2个样品,如癌症样品 vs 正常样品或是两个生物学重复,样品间的技术误差几乎可以忽略不计。


上图.  miRStar™ Human Cancer focused microRNA PCR芯片384孔板示意图每块PCR板可以同时检测2个样品(浅蓝色和深蓝色),红色圆圈表示内参。


microRNA
产品信息
Exiqon公司microRNA芯片
Exiqon公司microRNA LNA Knockdown探针
Exiqon公司microRNA原位杂交检测探针及优化试剂盒
Exiqon公司microRNA PCR芯片
Arraystar公司miRStar™ qPCR配套试剂:cDNA Synthesis Kit
Arraystar公司miRStar™人肿瘤相关microRNA PCR芯片
Arraystar公司miRStar™ qPCR配套试剂:SYBR® Green Master Mix
Arraystar公司miRStar™ qPCR配套试剂:microRNA特异性PCR引物
Arraystar miRStarTM Cancer Focus miRNA PCR研究配套试剂
Exiqon miRNA研究配套试剂
miRStar™ Pre-designed miRNA-specific Primers
技术服务
microRNA芯片技术服务
microRNA测序服务
microRNA实时定量PCR技术服务
microRNA PCR芯片技术服务
miRStar™ Cancer Focus microRNA PCR芯片技术服务
相关文献
microRNA表达异常的成因及临床意义
全球首次系统性检测高血压病人血浆中microRNA
Nature子刊:应用Exiqon miRNA qPCR Panel,探索胃癌血浆标志物
准确检测血清血浆样本中microRNA的利器与应用
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