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 nrStar™ tRF&tiRNA PCR芯片技术服务
      作为一种新型的tRNA来源的非编码小RNAtRF& tiRNA由精确调控的生物发生过程所产生,参与行使多种生物学功能: 作为microRNA参与RNA干扰;调节靶向mRNA的稳定性;在细胞应激条件下促进应激颗粒(SG)的组装;调控细胞凋亡;作为表观遗传因子在世代间传递。tRFs& tiRNA的组成和含量高度依赖于细胞类型,并且与多种病理状态密切相关。它们在生物体液中广泛存在,含量远超microRNA,使之有望成为极佳的分子标志物。
      Arraystar
公司最新发布的 nrStar™ Human tRF & tiRNA PCR Array包含了185类来自权威数据库收录和最新文献报道的tRFtiRNA,方便客户对tRF & tiRNA进行简单快捷地表达谱分析。

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR芯片服务列表

服务 

芯片

规格

描述

NEW  nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array Service

NEW nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array

384-well (2*192) plate

包含了185类来自权威数据库收录和最新文献报道的tRFtiRNA

芯片特点
● 前沿近年来tRF & tiRNA研究呈井喷式的增长
● 
专注专注于出现频次高、生理病理关联性强的tRF&tiRNA类群
● 
严谨每一对qPCR引物都经过精心地优化和严格地测试
● 
便捷随取随用,极致便捷;标准qPCR板型直接测样,无需预扩增

康成tRF&tiRNA PCR芯片服务实验流程
1. RNA抽提与质量检测
    进行RNA常规抽提,使用NanoDrop ND-1000检测RNA浓度和纯度,使用琼脂糖凝胶电泳检测RNA纯度和完整性。详细的样品QC结果见Arraystar服务报告。
2. 
双端接头连接与cDNA合成
    每样本取1.5 μg RNA,使用rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor) (Cat# AS-FS-003, Arraystar) 试剂盒进行接头连接和反转,合成cDNA第一链。详细步骤参照Arraystar产品操作手册。
3. Real-time PCR
扩增
    cDNA Arraystar SYBR Green qPCR Master Mix (Cat# AS-MR-005-5, Arraystar)混合,加入至384孔板中,在ABI 7900 PCR仪上进行Real-time PCR扩增。
4. 
熔解曲线分析与原始数据导出
    PCR扩增完成后,进行熔解曲线分析,使用PCR仪自带软件导出原始数据。出具Raw Data文件夹,包含原始Ct值、PCR扩增曲线图和熔解曲线图。

康成tRF&tiRNA PCR芯片服务数据分析流程
1. PCR芯片数据质控
    质控参数:Ct(Blank)>35; Ct(GDC)>35; Ct(RNA Spike-in)<25; Ct (PPC) <25. 符合上述条件的样本进入下一步分析。数据QC结果见Arraystar服务报告。
2. 
数据校正与Ct值计算
    板间校正:使用Ct(PPC)对不同PCR板进行板间校正。
   
内参校正与Ct值计算:挑选最优内参,使用内参均值计算Ct值。
3. 
差异倍数计算 (2^(-△△Ct))
    使用 △△Ct 方法计算不同样品组之间的表达差异倍数。

4. P
值计算
    对样本组进行t检验,计算P值。
5. 
其他常规数据分析
    散点图分析;火山图分析;TOP20表达上调和下调tRF&tiRNA柱形图分析
6. 
提供服务报告与数据分析结果
    a. Arraystar服务报告(包括RNA样本QCqPCR数据QC和详细实验数据分析步骤)
    b. Excel
芯片结果汇总表(包括tRF&tiRNA列表,数据分析结果和各类图表)
    c. Raw Data
文件夹 (包含原始数据、扩增曲线图和熔解曲线图)

康成tRF&tiRNA PCR芯片服务部分数据分析结果展示
1. 差异表达tRF & tiRNA列表(默认筛选参数:差异倍数>2P<0.05,客户可指定筛选参数值)

2. 散点图 (黑色斜线代表差异倍数为1,红色斜线代表差异倍数为2)  

         

3. 火山图(黑色垂线代表差异倍数为1;粉色垂线代表上调或下调倍数为2;蓝色水平线代表P值为0.05

     

4. TOP20表达上调tRF & tiRNA柱状图
 

5. TOP20表达下调tRF & tiRNA柱状图
 


tRF/tiRNA/tRNA
产品信息
nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array
nrStar™ Human tRNA Repertoire PCR Array
技术服务
tRF & tiRNA实时定量PCR技术服务
tRNA测序服务
tRF&tiRNA测序服务
nrStar™ Human tRNA Repertoire PCR Array
nrStar™ tRF&tiRNA PCR芯片技术服务
相关文献
tRNA相关研究背景介绍
tRF&tiRNA:为什么以及如何研究它们?
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